Bioinformatiker til Klinisk Mikrobiologisk Afdeling,
Denne stilling er desværre ikke længere ledig.
Se alle ledige stillinger
Slagelse
Er du vores nye bioinformatiker?
Klinisk Mikrobiologisk Afdeling (KMA) i Region Sjælland søger en engageret bioinformatiker til at varetage afdelingens analyse af sekvenser. Arbejdsstedet for denne stilling er placeret på Slagelse Sygehus indtil afdelingen i 2025 flytter til Køge.
Vi ønsker stillingen besat af en akademiker, som arbejder anerkendende og dialogbaseret, og som kan navigere i et bredt felt af interessenter og samarbejdspartnere både internt og eksternt. Du skal være nysgerrig på kvalitet, udvikling og forskning.
Vi tilbyder
Dine arbejdsopgaver
Din baggrund og dine kvalifikationer
Kort om hvem vi er
Den regionale mikrobiologiske enhed består af en hovedafdeling i Slagelse og en satellit i Nykøbing F. I den samlede enhed er der ansat 135 medarbejdere bestående af: Overlæger, bioanalytikere, laboranter, molekylærbiologer, bioinformatikere, sekretærer og hygiejnesygeplejersker. Vi er et certificeret laboratorium efter ISO 9001, akkrediteret efter ISO 15189 på flere analyser.
Afdelingen har en professor og har en stor forskningsaktivitet og flere Ph.d. studerende er tilknyttet. Afdelingen udfører ca. 1.000.000 mikrobiologiske prøver om året, fra hele Region Sjælland.
I 2025 er der planlagt en Klinisk Mikrobiologisk Afdeling på universitetshospitalet i Køge og du skal være indstillet på at kunne arbejde der i 2025.
Klinisk Mikrobiologisk Afdeling (KMA) i Region Sjælland søger en engageret bioinformatiker til at varetage afdelingens analyse af sekvenser. Arbejdsstedet for denne stilling er placeret på Slagelse Sygehus indtil afdelingen i 2025 flytter til Køge.
Vi ønsker stillingen besat af en akademiker, som arbejder anerkendende og dialogbaseret, og som kan navigere i et bredt felt af interessenter og samarbejdspartnere både internt og eksternt. Du skal være nysgerrig på kvalitet, udvikling og forskning.
Vi tilbyder
- Et spændende arbejde i tværfaglige teams med engagerede kollegaer.
- Arbejde i et fag med stort udviklingspotentiale og en afdeling i vækst.
- En arbejdsplads med et godt og rummeligt arbejdsmiljø – og med en positiv stemning i vores lyse laboratoriefaciliteter.
- Gode muligheder for udvikling af kompetencer og til faglig fordybelse.
- Der er mulighed for hjemmearbejdsdage med konkrete opgaver.
Dine arbejdsopgaver
- Ansvar for udvikling og vedligehold af NGS-diagnostik i afdelingen.
- Ansvar for den daglige drift af afdelingens NGS-baserede diagnostik og typningsmetoder i samarbejde med tilknyttede bioanalytikere, laboranter, kliniske akademikere og læger.
- Ansvar for optimering og vedligehold af bioinformatisk pipeline i forhold til SARS-CoV-2 sekventering og overvågning.
- Ansvar for optimering og vedligehold af bioinformatisk pipeline og databaser i forhold til mikrobiomundersøgelser af patientmateriale.
- Ansvar for implementering og vedligehold af bioinformatiske pipelines og databaser i forbindelse med typning, udbrudshåndtering og resistensbestemmelse af bakterielle isolater.
- Udvikling af brugervenlig UI til pipelines som kan benyttes af laboratoriepersonalet.
- Deltage i afdelingens forskning, udvikling og uddannelse af bachelor-, master-, ph.d.-studerende samt afdelingens personale.
- Indgå i et netværk med bioinformatikere fra andre klinisk mikrobiologiske afdelinger og Statens Serum Institut.
- Kunne trække data fra afdelingens LIS system.
Din baggrund og dine kvalifikationer
- Akademisk grad indenfor bioinformatik, computervidenskab eller anden relevant disciplin.
- God erfaring i at programmere og udvikle i et UNIX-miljø.
- Kompetencer indenfor programmering i Python og/eller R.
- Erfaring med opsætning/kodning af pipelines i eksempelvis Snakemake eller Nextflow.
- Teoretisk og praktisk erfaring med NGS-dataanalyse, samt kendskab til brugen af forskellige sekventeringsplatforme (Nanopore, Illumina).
- Kendskab til brugen af Computerome.
- Erfaring inden for mikrobiologi er en fordel.
- Du er udviklingsorienteret, struktureret og analytisk.
- Gode samarbejdsevner på tværs af faggrupper, lokalt og nationalt.
- God til, både selvstændigt og som en del af et team, at arbejde for effektivt at møde deadlines.
- Du kan både være nyuddannet med viljen og lysten til at lære, eller en mere erfaren profil med relevant erhvervserfaring.
Kort om hvem vi er
Den regionale mikrobiologiske enhed består af en hovedafdeling i Slagelse og en satellit i Nykøbing F. I den samlede enhed er der ansat 135 medarbejdere bestående af: Overlæger, bioanalytikere, laboranter, molekylærbiologer, bioinformatikere, sekretærer og hygiejnesygeplejersker. Vi er et certificeret laboratorium efter ISO 9001, akkrediteret efter ISO 15189 på flere analyser.
Afdelingen har en professor og har en stor forskningsaktivitet og flere Ph.d. studerende er tilknyttet. Afdelingen udfører ca. 1.000.000 mikrobiologiske prøver om året, fra hele Region Sjælland.
I 2025 er der planlagt en Klinisk Mikrobiologisk Afdeling på universitetshospitalet i Køge og du skal være indstillet på at kunne arbejde der i 2025.
- Ansøgning sendes elektronisk ved at trykke på linket i annoncen.
- Samtaler vil være den 26. maj 2023.
- Stillingen er 1. juli eller efter aftale
- Har du spørgsmål til stillingerne kan du kontakte enten chefbioanalytiker Pia Krohn Hansen, tlf. 28114280 eller cheflæge Ulrich Stab Jensen, tlf. 93567029.
Information og data
Denne ledige stilling har jobtypen "Biolog", og befinder sig i kategorien "Sundhed og forskning".
Arbejdsstedet er beliggende i Slagelse.
Jobbet er oprettet på vores service den 2.5.2023, men kan have været deaktiveret og genaktiveret igen.
Dagligt opdateret: Dette job opdateres dagligt ud fra jobudbyderens hjemmeside via vores søgemaskineteknologi og er aktivt lige nu.
- Biolog
- Slagelse
- Mandag den 22. maj 2023
Lignende jobs
-
Biolog i Roskilde
Vil du være med til at sikre den optimale behandling af Danmarks radioaktive affald? Og samtidig sætte dit præg på løsningen af en unik dansk samfundsopgave? – Så er det dig vi søger til vores .Få mere info- Biolog
- Roskilde
-
Biolog (studiejob) i Hele Danmark
Få mere info- Biolog
- Hele Danmark
Statistik over udbudte jobs som biologer i Slagelse
Herunder ser du udviklingen i udbudte biolog i Slagelse over tid. Bemærk at jobs der ikke har en bestemt geografi ikke er medtaget i tabellen. I den første kolonne ser du datoen. I den næste kolonne ser du det samlede antal biologer.
Se flere statistikker her:
Statistik over udbudte biologer over tid
| Dato | Alle jobs som biologer |
|---|---|
| 2. maj 2024 | 1 |
| 1. maj 2024 | 1 |
| 30. april 2024 | 1 |
| 29. april 2024 | 1 |
| 28. april 2024 | 1 |
| 27. april 2024 | 1 |
| 26. april 2024 | 1 |
| 25. april 2024 | 1 |
| 24. april 2024 | 1 |
| 23. april 2024 | 1 |
| 22. april 2024 | 1 |
| 21. april 2024 | 1 |
| 20. april 2024 | 1 |
| 19. april 2024 | 1 |
| 18. april 2024 | 1 |
| 17. april 2024 | 1 |
| 16. april 2024 | 1 |
| 15. april 2024 | 1 |
| 14. april 2024 | 1 |
| 13. april 2024 | 1 |
| 12. april 2024 | 1 |
| 11. april 2024 | 1 |
| 10. april 2024 | 1 |
| 9. april 2024 | 1 |
| 8. april 2024 | 1 |